Ich hatte das gleiche Problem.
Ich habe darauf in Optionen/Erweitert einen Haken vor "Programm nach benutzerdefinierter Bereinigung schließen" gesetzt.
Anschließend die Erweiterte Bereinigung durchgeführt.
Erwartungsgemäß wurde die Bereinigung durchgeführt und das Programm verschwand in der Taskleiste.
Beim nächsten Start entfernte ich wieder den Haken und die Bereinigung wurde normal durchgeführt, so wie vor dem Update des Programms.